X - Curso de verão em Bioinformática

Apresetação do curso

Dentro do contexto da pesquisa em oncologia, dados de expressão gênica permitem a análise de associação com fatores de prognósticos importantes, tais como resposta a tratamento, risco de recorrência e sobrevida. Identificar o conjunto de genes cujo perfil de expressão demonstre uma associação significativa com fatores prognósticos é um dos grandes desafios da medicina translacional. A proposta do curso de verão 2017 é integrar dados públicos de genoma completo de vários tumores, métodos estatísticos e ferramentas de bioinformática para identificar assinaturas de expressão gênica associadas com fatores prognósticos.

Objetivo

O curso tem como objetivo principal apresentar um cenário real de elaboração e execução de um projeto em Bioinformática para alunos de graduação e/ou pós-graduação. Serão oferecidos conhecimentos fundamentais sobre as ferramentas de bioinformática desenvolvidas para tratar as questões biológicas relacionadas ao tema do curso.

Formato do curso

O curso divide-se em duas partes, uma Teórica Introdutória e outra Prática. A parte Teórica Introdutória tem o objetivo de apresentar um problema biológico, assim como as abordagens de Bioinformática que podem ser utilizadas para estudá-lo. A atividade Prática consiste da maior parte do curso, dedicada a investigar o problema biológico apresentado através de abordagens computacionais e experimentais. Serão formados grupos com alunos de diversas áeras de conhecimento, promovendo uma discussão multidisciplinar para resolução do problema a ser investigado. Desta forma, o curso propõe um cenário real para aplicação da Bionformática.

Número de vagas: 20.

Carga horária: 73 horas.

Datas

Período de inscrição: 10/10/2016 a 02/12/2016.

Divulgação dos selecionados: 09/12/2016.

Confirmação dos selecionados: 13/12/2016.

Período do curso: 16/01/2017 a 27/01/2017.

Maiores informações: cvbioinfo2017@gmail.com.

Inscrição

Para a realização do curso, é necessário preencher o formulário abaixo que estará disponível neste site no período de 10/10/2016 a 02/12/2016. Além de algumas informações sobre a área de conhecimento, será necessário enviar o currículo em formato eletrônico.

O curso destina-se a alunos de gradução, pós-graduação e profissionais da área.

Taxa de Inscrição

Nenhuma taxa será cobrada para a inscrição ou participação no Curso de Verão em Bioinformática.

Auxílio Financeiro

Não fornecemos nenhum tipo de Auxílio Financeiro, portanto os alunos selecionados para participarem do Curso de Verão deverão arcar com todas as suas despesas de transporte, hospedagem e alimentação.

Período de inscrição: 10/10/2016 a 02/12/2016.

Maiores informações: cvbioinfo2017@gmail.com.

Selecionados

  • Adriana Di Battista

  • André Luiz Molan

  • Danillo Silva

  • Diônata Augusto

  • Gabriel da Silva

  • Gabriel Rubio

  • Gabriela Santos

  • Kelin Oliveira

  • Leonardo Ernesto

  • Luciana Mofatto

  • Marco Pollo

  • Murilo Henrique Anzolini Cassiano

  • Omar Julio Sosa

  • Rafael Correia da Silva - Não confirmado

  • Ronaldo Junior

  • Sávio Vieira

  • Sheyla Trefflich - Não confirmado

  • Victor Ramos

  • Yagoub Ali Ibrahim Adam

  • Yonara Cordeiro

Segunda chamada

  • Carlos Biagi Jr

  • Marina Cruz

Programação

Primeira semana

Horário Segunda 16/01 Terça 17/01 Quarta 18/01 Quinta 19/01 Sexta 20/01
08:30-09:00 *Abertura
Wilson Araújo da Silva Jr
*Palestra: Medicina Translacional
Daniel Vidal
*Aula Teórico/Prática: TCGA Artigos TCGA
Grupo alunos
*Aula Teórica: BD
Marcelo Gomes de Paula
09:00-10:00 *Aula Teórica: Transcriptoma/Cancer *Aula Teórica R/Bioconductor
Jessica Plaça
10:00-10:30 Coffee-Break
10:30-12:00 *Palestra de aplicação: NGS
Illumina
*Lógica de programação
Erico Torrieri
*Interquattri / Artigos *Palestra de aplicação
JL Network
*Aula Teórica: BD
Marcelo Gomes de Paula
12:00-13:30 Almoço
13:30-14:30 Aula Teórica: Análise RNA-seq
Daniel Guariz Pinheiro
Aula Teórica/Prática: Introdução ao Linux
Marcelo Gomes de Paula
Aula Pratica: Biocoductor/TCGAbiolinks
Jessica Plaça
Aula Pratica: Bioestatística
Cleyton(HCB)
Aula Teórica/Pratica
Marcelo Gomes de Paula
14:30-15:30 Aula Teórica/Prática: Introdução ao R
Jessica Plaça
Baixar dados TCGA Discussão Projeto
15:30-16:00 Coffee-Break
16:00-18:00 Aula Teórico/Prática: RNA-seq
Daniel Guariz Pinheiro
Aula Teórica/Prática: Introdução ao R
Jessica Plaça
Aula Teórica/Pratica: R/Bioconductor
Jessica Plaça
Aula Prática: Bioestatística
Cleyton (HCB)
Aula Prática: R/MySQL
Marcelo Gomes de Paula

*Palestras abertas

Segunda semana

Horário Segunda 23/01 Terça 24/01 Quarta 25/01 Quinta 26/01 Sexta 27/01
08:30-10:00 Análise expressão diferencial EDGR PCA Modelar BD resultados Executar ferramenta Organização resultados
10:00-10:30 Coffe-Break
10:30-12:00 Análise expressão diferencial EDGR ROC Modelar BD resultados Executar ferramenta Organização resultados
12:00-13:30 Almoço
13:30-16:00 Gerar assinaturas c/ genes D. Expressos Cox Implementar BD Carregar resutlados BD Apresentação resultados
16:00-16:30 Coffe-Break
16:30-18:00 Gerar assinaturas c/ genes D. Expressos Kaplan Meier Implementar BD Carregar resutlados BD Apresentação resultados

Local

USP/Centro Regional de Hemoterapia do HC-FMRP-USP
Rua Tenente Catão Roxo, 2501
Ribeirão Preto, SP
Fone:(16) 2101-9604

Sugestão de Hospedagem

Casa de Hóspedes (Campus da USP)

Contato: Meire Vieira C. Tarla
Fone:(16) 2101-9362
Email:tarla@hemocentro.fmrp.usp.br
Apartamento do Lucas
Av Caramuru, 2450.
Fone: (48) 9149-8675
Email:goedertlucas@gmail.com
Pensão da Jô
Rua Appa 950, cruzamento com Rua Padre Anchieta
Fone: (16) 3966-4334 (16) 3966-4334
Email:dettimoreno@yahoo.com.br
Vita Et Pax
Av. Abade Constantino, 150 - Jardim Recreio
Fone: (16) 3630-6555 (16) 3630-6263
Site: https://www.facebook.com/PensionatoVitaEtPax/
Hotel Pousada Santa Rita
Av. do Café, 2295.
Fone: (16) 3966-5404 (16) 3966-6409
Site: http://hotelpousadasantarita.com.br/
Hotel Dan Inn Ribeirão Preto
Rua Coronel Luiz da Cunha, 404, Vila Tibério
Fone: (16) 3605-1500
Site: http://www.nacionalinn.com.br/ribeirao-preto/dan-inn-ribeirao-preto/?locale=pt_BR
Dan Inn Express Ribeirão Preto
Rua Coronel Luiz da Cunha, 366, Vila Tibério
Fone: (16) 2133-4000
Site: http://www.nacionalinn.com.br/ribeirao-preto/dan-inn-express-ribeirao-preto?locale=pt_BR
Hostel Araucária Rua Aquidauana, 643, Jd. Antártica CEP 14051-210 Fone: (16) 3289-7939 (16) 99299-9774 Site: http://www.pensionatoaraucaria.net.br/
Pensionato Paris Rua Aquidauana, 545, Monte Alegre Fone: (16) 99796-3004 (16) 3630-6037 Site: http://www.pensionatoparis.com.br/
Pensionato USP RP
Rua Nioac, 165 (Feminino) / Rua Bela Vista, 860 (Masculino)
Fone: (16) 3021-3989 (16) 3633-0653
Site: http://www.pensionatousprp.com/

Notícias

Confirmado a X edição do curso de verão

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