Integração de ferramentas in silico para predizer as funções regulatórias e não-regulatórias dos lncRNAs

Os RNAs longos não codificantes (lncRNAs) são uma classe de RNAs com mais de 200 nucleotídeos que não codificam proteínas. Estudos recentes demonstraram que essas moléculas executam papéis importantes na biologia do câncer, e seus níveis de expressão podem estar associados à metástase, prognóstico e recorrência de câncer. Os lncRNAs podem exercer relações regulatórias e não-regulatórias que abrangem uma diversidade de mecanismos funcionais envolvidos em processos epigenéticos, transcricionais ou pós-transcricionais complexos, muitos dos quais empregam capacidade dos lncRNAs de se ligarem de uma maneira específica à sequências de DNA, RNA ou proteína. Os dados de RNA-Seq podem ser utilizados na compreensão dos processos biológicos e essa informação de expressão global fornece um recurso rico para identificar potenciais relações regulatórias ao nível de RNA.


Apresentação do curso

A proposta do Curso de Verão em Bioinformática 2019 é a integração de ferramentas in silico que possam predizer as funções regulatórias e não-regulatórias dos lncRNAs aliadas ao uso bancos de dados públicos com dados de expressão dos lncRNAs para a construção de evidências de função e/ou classe funcionais que podem ser usadas para compreender alguns mecanismos do câncer e guiar uma possível caracterização experimental efetiva dos lncRNAs.

Objetivos

O curso tem como objetivo principal apresentar um cenário real de elaboração e execução de um projeto em Bioinformática para alunos de graduação e/ou pós-graduação. Serão oferecidos conhecimentos fundamentais sobre as ferramentas de Bioinformática desenvolvidas para tratar as questões biológicas relacionadas ao tema do curso.

Formato

O curso divide-se em duas partes, uma Teórica Introdutória e outra Prática. A parte Teórica Introdutória tem o objetivo de apresentar um problema biológico, assim como as abordagens de Bioinformática que podem ser utilizadas para estudá-lo. A atividade Prática consiste da maior parte do curso, dedicada a investigar o problema biológico apresentado através de abordagens computacionais e experimentais.
Serão formados grupos com alunos de diversas áreas de conhecimento, promovendo uma discussão multidisciplinar para resolução do problema a ser investigado. Desta forma, o curso propõe um cenário real para aplicação da Bioinformática.

50%

Informática

50%

Biológia

100%

Bioinformática

Quer conhecer e praticar bioinformática?

O curso de verão em bioinfomática propõe um cenário real para aplicação da Bioinformática.

Datas importantes

Período de inscrição: 03/09/2018 até 31/10/2018

Divulgação dos selecionados (1ª Chamada): 09/11/2018 às 17hrs

Confirmação dos selecionados (1ª Chamada): até 14/11/2018 - Até às 23h59

Divulgação dos selecionados (2ª Chamada): 16/11/2018 - às 17h

Confirmação dos selecionados (2ª Chamada): até 21/11/2018 - Até às 23h59

Período do curso: 28/01/2019 a 08/01/2019.

Aulas


Regulação Gênica em Câncer: IncRNA

Co-expressão

Ética em genômica

Experimento Pull Down

Experimentos em expressão gênica

Linux/Bash

IncRNAs

Lógica de Programação

Next Generation Sequencing (NGS)

Python

R - Estrutura e manipulação de dados

R/Bioconductor - Expressão diferencial

ChiP-Seq

SGBD

TCGA-TOIL

Inscrição Aberta

Formulário de inscrição

Para a realização do curso, é necessário preencher o formulário que estará disponível neste site no período de 03/09/2018 até 31/10/2018.
Além de algumas informações sobre a área de conhecimento, será necessário enviar o Currículo Lattes em formato eletrônico.O curso destina-se a alunos de graduação, pós-graduação e profissionais da área.


Taxa de inscrição

Nenhuma taxa será cobrada para a inscrição ou participação no Curso de Verão em Bioinformática, mas vontande de aprender e ensinar são pré-requisitos

Auxílio Financeiro

Não fornecemos auxílio financeiro, os alunos selecionados deverão arcar com todas as suas despesas de transporte, hospedagem e alimentação.

Agenda


28/01/2019

08:30-09:00 Abertura
09:00-10:00 IncRNAs
10:30-10:30 Bit
10:30-12:00 TOIL
13:30-15:30 Linux/Bash
15:30-18:30 Linux/Bash

29/01/2019

08:30-10:00 Regulações genica em câncer: IncRNA
10:30-12:00 Next Generation Sequencing
13:30-15:30 Python
16:00-18:00 Python

30/01/2019

08:00-10:00 Experimentos em expressão gênica
10:30-12:00 Em breve
13:30-15:30 R
16:00-18:00 Expressão diferencial

31/01/2019

08:30-10:00 Em breve
10:30-12:00 Artigos
13:30-15:30 SGBD
16:00-18:00 SGBD

01/02/2019

08:30-10:00 - Artigos
10:30-12:00 Em breve
13:30-15:30 Co-expressão
16:00-18:00 Projeto

02/02/2019

Sem atividade prevista


04/02/2019

08:30-10:00 Excução do projeto
10:30-12:00 Execução do projeto
13:30-15:30 Execução do projeto
16:00-18:00 Execução do projeto

05/02/2019

08:30-10:00 Excução do projeto
10:30-12:00 Execução do projeto
13:30-15:30 Execução do projeto
16:00-18:00 Execução do projeto

06/02/2019

08:30-10:00 Excução do projeto
10:30-12:00 Execução do projeto
13:30-15:30 Execução do projeto
16:00-18:00 Execução do projeto

07/02/2019

08:30-10:00 Excução do projeto
10:30-12:00 Execução do projeto
13:30-15:30 Execução do projeto
16:00-18:00 Execução do projeto

08/02/2019

08:30-10:00 Excução do projeto
10:30-12:00 Execução do projeto
13:30-15:30 Execução do projeto
16:00-18:00 Execução do projeto

09/02/2019

Sem atividade prevista

Local - Hemocentro de Ribeirão Preto

Rua Tenente Catão Roxo, nº 2501 – Bairro Monte Alegre
Ribeirão Preto - SP


Sugestões de Hospedagem

Casa de Hóspedes

Meire Vieira C. Tarla
(16) 2101-9362
tarla@hemocentro.fmrp.usp.br

Pensão da Jô

(16) 3966-4334
(16) 3966-4334 dettimoreno@yahoo.com.br

Vita Et Pax

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